Основным анатомическим признаком трикуспидальной атрезии является отсутствие сообщения, между правым предсердием и правым желудочком, поскольку между ними располагается мышечно-соединительнотканная пластинка. Обе стороны пластинки, обращенные в полость правого предсердия и правого желудочка, покрыты тонким эндокардом. Периферические отделы пластинки состоят из мышечной ткани, центральный отдел — из тонкого листка соединительной ткани.

Толщина пластинки в разных ее отделах неодинакова. Периферические (мышечные) части пласпинки, у места ее прикрепления к фиброзному кольцу, имеют толщину 0,26 см (в среднем), центральный (соединительнотканный) отдел пластинки — 0,1 см и менее. В одном наблюдении в соединительнотканной (центральной) части пластинки отмечалось отверстие неправильно округлой формы, диаметром 0,3 см. На поперечном разрезе пластинка имеет форму двух узких конусов, вершины которых обращены друг к другу, а основания покоятся на противоположных точках фиброзного кольца.

Во всех наблюдениях наряду с атрезией правого атриовентрикулярного отверстия определялась гипоплазия правого желудочка. Полость его имела щелевидную форму и была как бы сплющена спереди назад. Во всех 7 наблюдениях при трикуспидальной атрезии отмечались дефекты межжелудочковой перегородки, располагавшиеся в мембранозной ее части. В 1 из 7 наблюдений было два дефекта в мембранозной части межжелудочковой перегородки диаметром 0,3 см каждый. Дефект межжелудочковой перегородки имел неправильно округлую или овальную форму. Средний диаметр дефекта межжелудочковой перегородки составлял 0,77 см.