В условиях недостаточного питания и содержания в пище жира организм должен всегда иметь запас легкодоступных триглицеридов (ТГ), чтобы покрывать энергетические потребности. Эта функция накопления осуществляется за счет секреции печенью частиц ЛОНП. Липопротеинами очень низкой плотности (ЛОНП) являются липопротеины богатые триглицеридами (ЛБТ) более мелкими, чем хиломикроны (ХМ). В качестве основного апо они содержат апо В100. В отличие от апо В48, апо В100 содержит участок (домен), распознаваемый ЛНП-рецептором (апо В/Е-рецептором). Частицы ЛОНП следуют тем же катаболическим путем, что и ХМ, подвергаясь действию ЛПЛ.

Во время гидролиза липопротеинов богатых триглицеридами (ЛБТ) под действием ЛПЛ происходит обмен белками и липидами: частицы ЛОНП (и ХМ) приобретают апо С и апо Е, частично из ЛВП. ТГ, входящие в состав ЛОНП, обмениваются па ЭХС из частиц ЛВП, что опосредуется белком, переносящим эфиры холестерина (БПЭХС). Такой двунаправленный перенос компонентов между липопротеинами преследует несколько целей: приобретение липопротеинами специфических аполипопротеинов, которые будут определять их метаболизм; перенос ФЛ на насцентные (вновь синтезированные) частицы ЛВП, опосредованный белком, переносящим фосфолипиды (БПФЛ) (во время потери ТГ из ядра липопротеиновой частицы фосфолипидная оболочка становится излишней и сбрасывается на апо AI с формированием новых частиц ЛВП); перенос ХС от ЛВП к ремнантам ЛОНП, чтобы ХС мог метаболизироваться в печени. Этот обмен компонентами — главная часть механизма обратного транспорта холестерина (ХС).

После гидролиза триглицеридов (ТГ) липопротеины очень низкой плотности (ЛОНП) частично обедняются триглицеридами, поэтому содержат относительно больше ХС. Они теряют ряд апо (особенно апо С) и получают апо Е. Ремнанты ЛОНП, называемые липопротеинами промежуточной плотности (ЛПП), захватываются печенью через содержащийся в них аполипопротеин Е (апо Е) или делипидируются посредством печеночной липазы, формируя частицы ЛНП. Существуют по меньшей мере четыре рецептора для липопротеинов богатых триглицеридами (ЛБТ), ремнантов ЛБТ и липопротеинов, содержащих апо В: ЛОНП-рецептор, ремнантный рецептор, ЛНП-рецептор (также называемый апо В/Е-рецептор) и пептид, родственный ЛНП-рецептору. Большинство печеночных рецепторов обладают способностью распознавать ано Е, за счет чего обеспечивается захват липопротеинов нескольких классов, включая ЛОНП и ЛПП. Взаимодействие между апо Е и его лигандом является сложным процессом и включает связывание ЛБТ с гепарансульфатными протеогликанами перед презентацией лиганда рецептору.