При дефекте межжелудочковой перегородки септический эндокардит также является частым осложнением. По данным Abbot (1936), Askenasy (1960), он наблюдается в 20—25% случаев, Crafford, Bjork (1959) — в 10%, Л. Г. Беловой и Ф. И. Францева (1963) — в 16,6% случаев. Ichaede (1960) обнаружил бактериальный эндокардит у 44 из 127 наблюдаемых им больных.

Однако он указывал, что в это количество он включил больных с неясными лихорадочными заболеваниями в анамнезе, с наличием аортальной или пульмональной недостаточности. Л. Г. Белова и В. И. Францев (1963) наблюдали бактериальный эндокардит у 6 из 32 больных, Л. Г. Белова и В. Н. Обухов (1964) — у 8 из 77. В это количество авторы включают как клинические наблюдения, так и случаи выявления бородавчатых разрастаний в области дефекта межпредсердной перегородки на операции и секции без выраженной клинической симптоматики. В литературе имеются противоречивые данные о частоте бактериального эндокардита при дефекте межпредсердной перегородки. Ряд исследователей (Roesler, 1934; Gross, 1960, и др.) совершенно отрицают возможность осложнения данного порока сердца бактериальным эндокардитом. Многие (Abbot, 1936; Kielberg, 1955; В. Йонаш, 1960, и др.) считают, что при дефекте межпредсердной перегородки он наблюдается редко. Наряду с этим Littman и Fono (1954) считают септический эндокардит частым осложнением.